Ročníkový projekt 2024/2025
Webová aplikácia na analýzu genetických údajov a identifikáciu potenciálnych chorôb
Projekt sa zameriava na vývoj webovej aplikácie na analýzu genetických údajov, ktorá identifikuje potenciálne zdravotné riziká a choroby. Aplikácia bude môcť zobrazovať aj doplnkové údaje, ako sú farba očí, vlasov a pohlavie.
Študent
Meno: Anatolii Izotov
Email: izotov1@uniba.sk
Školiteľ
Meno: prof. RNDr. Rastislav Královič PhD.
Email: rastislav.kralovic@fmph.uniba.sk
Plán práce
Zimný semester
- Analýza existujúcich metód spracovania genetických údajov
- Preskúmanie technológií a algoritmov pre detekciu potenciálnych chorôb
- Vývoj modulu v Java na spracovanie VCF súborov (anotácia a filtrovanie pomocou
SnpEff)
- Vývoj modulu v Pythone na analýzu údajov s využitím
Gemini
- Príprava základnej dokumentácie pre jednotlivé moduly a ich interakciu
Letný semester
- Integrácia Pythonového modulu na analýzu údajov s Java aplikáciou
- Vývoj a optimalizácia logiky na získanie a formátovanie výsledkov analýzy
- Testovanie použiteľnosti aplikácie